Η ελληνική μυθολογία είναι η πηγή του ονόματος της Ζακύνθου, καθώς Ζάκυνθος ήταν στην πραγματικότητα ο γιος του Τρώα βασιλιά Δαρδάνου. Σε αυτό το νησί κατέφυγε από την Τροία για να βρει καταφύγιο μετά την Τρωική εκστρατεία.
Η Κεφαλονιά πήρε το όνομά της από τον πρώτο κυβερνήτη του νησιού, τον Κέφαλο, ήρωα από την Αθήνα και γιο του Διονύσου. Εξορίστηκε στο νησί που τώρα φέρει το όνομά του, αφού βοήθησε τον Αμφιτρύωνα των Μυκηνών σε έναν πόλεμο εναντίον τοπικών φυλών.
Το όνομα της Κέρκυρας προέρχεται από τη νύμφη Κέρκυρα, κόρη του ποτάμιου θεού Ασωπού και της ποτάμιας νύμφης Μετόπης. Ο Ποσειδώνας ερωτεύτηκε την Κορκύρα και την απήγαγε. Στη συνέχεια την πήγε στο νησί, δίνοντάς του το όνομά της. Ωστόσο σύμφωνα με άλλη θεωρία το όνομα Κέρκυρα προέρχεται από τη βυζαντινή λέξη coryfo, που σημαίνει κορυφή, η οποία αναφερόταν στην κορυφή του φρουρίου δίπλα στο λιμάνι, που ήταν η πρώτη εικόνα που αντίκριζαν τα πλοία κατά την άφιξή τους στο νησί.